雖然氟化鎂的化學性質很穩定,加熱不會分解,即使強電解也很難分離，因此一般對人體沒有傷害，但是長期接觸也會對人體造成一定的危害，如：引起氟斑牙和氟骨癥。如果直接口服氟化鎂，會引起流涎、惡心、嘔吐、腹瀉和腹痛，繼之震顫、昏迷，可因呼吸麻痹而死亡。